抗体研究中的人工智能和计算方法

人工智能 (AI) 和计算方法是抗体发现和工程的强大工具。尽管在小分子相关应用中历来很普遍,但在计算能力和创新算法激增的支持下,人工智能正逐步被用于治疗性抗体的发现和进步,通过下一代测序和相关药物模式(如VHH抗体)获得的数据越来越多。1

这些方法在抗体研究中的主要用途包括2:

  • 建立抗体数据库
  • 目标发现和验证
  • 结构和功能建模
  • 发展评估和活动改进
  • 从头抗体设计
  • 结合其他工具(例如生物信息学和 X 射线晶体学、蛋白质结构分析)

与抗体发现中常见的费力实验方法相比,这些计算方法可以提供更具成本效益和更快的周转时间。不断上升的成本往往是药物发现进展的重大障碍。

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引用:

  1. Norman,RA,Ambrosetti,F.,Bonvin,AM,Colwell,LJ,Kelm,S.,Kumar,S.和Krawczyk,K.(2020)。治疗性抗体设计的计算方法:既定方法和新兴趋势。生物信息学简报,21(5),1549-1567。https://doi.org/10.1093/bib/bbz095
  2. Kim, J., McFee, M., Fang, Q., Abdin, O., & Kim, PM(2023 年)。基于计算和人工智能的抗体开发方法。药理学趋势,44(3),175-189。https://doi.org/10.1016/J.TIPS.2022.12.005
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